En el marco del Plan de Ordenación y Manejo de la Cuenca Hidrográfica de la Ciénaga de Mallorquín y los Arroyos Grande y León en el departamento del Atlántico, la Corporación Autónoma Regional del Atlántico (CRA) realizó la instalación del segundo Consejo de Cuenca del departamento, el POMCA Mallorquín, de conformidad con lo preceptuado en el Decreto 1640 de 2012 “por medio del cual se reglamentan los instrumentos para la planificación, ordenación y manejo de las cuencas hidrográficas y acuíferos".

El Consejo de Cuenca es la instancia de participación ciudadana de todos los actores de la cuenca. La instalación se llevó a cabo en la sede de la Corporación, tras previa convocatoria realizada por la autoridad ambiental. 

El órgano consultivo está conformado por 12 miembros que representan varios sectores de la Cuenca, dentro de los que se encuentran las organizaciones del gremio campesino, entidades territoriales, gremios, instituciones de educación superior, juntas de acción comunal y ONG’s.

Así mismo, se realizó la elección del presidente y secretario del órgano consultivo de los dos períodos siguientes, resultando elegidos para el período 2016 al 2017 Efraín Cepeda Tarud como presidente, quien representa la Corporación Empresarial del Oriente del Atlántico y Patricia Elena Díaz como Secretaria, representando la Corporación Sociedad y Naturaleza -SONAT.

Para el período 2017 al 2018, el representante de las Instituciones de Educación Superior Boris Ernesto Rodríguez fue elegido como presidente del Consejo de Cuenca y Nubia Stella Merlano, actual Secretaria de Ambiente del municipio de Puerto Colombia, quien representa las entidades territoriales, asumió el cargo como secretaria, en el marco del proceso de conformación del consejo.

Hasta la fecha, la CRA ha avanzado en la conformación de dos Consejos de Cuenca en el departamento del Atlántico: Río Magdalena y Mallorquín. En el 2012, se conformó el Consejo de Cuenca del Complejo de Humedales del Río Magdalena, el cual comenzó su funcionamiento el día 15 de mayo del 2013.